Program 2021

Main event

From October 27th to 29th

14:00 - Open ceremony

Presença de toda a Diretoria executiva da AB3C e gestores das Regionais

14:30 - Medalha de mérito AB3C 2021

Neste ano a Diretoria Executiva da AB3C concede ao Prof. Dr. Guilherme Oliveira a Medalha AB3C de Reconhecimento de Mérito por sua atuação na Pós-graduação, pesquisa e desenvolvimento de novas ferramentas de análises, participação em comitês de pesquisa e associações científicas.

15:30 - Round table:  from academic to startup ceo

Federico Marque e Romina Casadeval
GRIDx

Rodrigo Bornhausen Demarch
Eretz.Bio

Mariana Zanatta Inglez
Parque Científico e Tecnológico e da Incubadora da Unicamp

17:00 - Keynote: RNA binding proteins as regulators, drugs and drug targets

Gene W. Yeo, Ph.D., MBA
Professor of Cellular and Molecular Medicine, University of California San Diego
https://iem.ucsd.edu/researchers/people/profiles/gene-yeo.html

18:30 - Xpress presentation, group 01

First Group of presenters 
Group information will be send to the presenting authors close to the event.

09:00 - ​The "Science" must drive the Data Science: the bioinformatician's challenge of turning data into knowledge

In the 21st century, science changed drastically. With high throughput techniques, we are producing biological information faster than ever. The speed impacted especially the omics sciences. Conference lectures and research articles are full of tables, figures, and numbers. However, in this scenario, something is missing: hypothesis, scientific insight, reproducibility, knowledge. Bioinformaticians are drowning in an ocean of data and struggling to convert this information into knowledge. This round table will discuss the challenges and directions for working in the omics sciences to answer relevant questions.

Chair: Dr. Mariana Boroni is an associate researcher at the National Cancer Institute (INCA), leader of the Bioinformatics and Computational Biology Laboratory; permanent professor of the Postgraduate Program in Oncology at INCA; co-founder of startups CellSeq and OneSkin, where she works coordinating Big Data analysis. She works in the field of Bioinformatics, Molecular Biology and Biochemistry, with an emphasis on analysis and integration of different omics, such as genomics, epigenomics and transcriptomics, and application of artificial intelligence techniques in the biology of cancer and aging.

Lecture 1: Dr. Gabriel Fernandes is currently a researcher at the René Rachou-Fiocruz Minas Institute, and an associate researcher at the Center for Basic Metabolic Research at the University of Copenhagen-Denmark. He has experience in Genetics, with an emphasis on Bioinformatics, working mainly in studies associated with Metagenomics and Microbiomes; Genomics; Identification of biomarkers and construction of predictive models; and development of databases and tools for analyzing biological data.

Lecture 2: Dr. Adriano Barbosa-Silva is a senior post-doctoral researcher in Artificial Intelligence for Medicine at the Medical University of Vienna. His background includes Bioinformatics, Text-mining, Translational Data Integration and Health Data Science.

10:30 - ​Acelerando Pesquisa e Invovação com uso de GPUs

Marcel Saraiva

Nessa apresentação mostraremos a plataforma NVIDIA Clara, com foco na solução PARBRICKS para processamento de genoma e Clara Discovery para pesquisa de novos medicamentos. Como soluções aceleradas em GPUs podem transformar a pesquisa e inovação na area de genoma e bioinformática.

12:00 - empowering science with intelligence

Vamos conversar com a Versatus HPC  sobre análises que necessitam sistemas de alto desempenho. Ao final será sorteada uma Amazon Alexa. A palestra é aberta ao público.
Assista pelo Facebook Assista pelo youtube

12:30 - lunch break

14:00 - Keynote: Mapeando a mente com palavras

Prof. Dr. Sidarta Ribeiro 
UFRN
A análise quantitativa de relatos orais ou escritos por meio de grafos semânticos e não-semânticos fornece ferramentas computacionais rápidas e de baixo custo para a avaliação estrutural e semântica do discurso. Nos últimos anos, aplicamos tais análises ao diagnóstico diferencial de psicose, à distinção entre doença de Alzheimer e comprometimento cognitivo leve, ao rastreio dos ganhos cognitivos em crianças saudáveis durante a alfabetização, à caracterização da estrutura do discurso oral em populações iletradas incluindo grupos ameríndios, e à comparação de todos esses dados com textos literários desde a Idade do Bronze até o presente. Essa pesquisa alcança os diversos domínios mentais induzidos por estados de sono e sonho, variações de humor e atenção, meditação, substâncias psicoativas e doenças psiquiátricas e neurológicas. O método também tem potencial para revelar novas perspectivas sobre falar, ler e, mais importante, aprender. A possibilidade de comparar a estrutura de textos antigos e atuais com os relatos orais de pessoas de diversas culturas, com ampla gama de idade, status socioeconômico e escolaridade, fornece novas perspectivas empíricas com grande potencial de descoberta.

15:00 - Round table: ​Running from the wet lab and choosing bioinformatics: the path of The Force.

Prof. Dr. Georgios Joannis Pappas Júnior
IB - UNB
Brasilia, DF - Brasil


Prof Dr. Edward T. Himelblau
Biological Science
Cal Poly
San Luis Obispo, CA

http://www.himelblog.com

16:30 - Keynote: JGI's data systems/portals: FAIR data 

Dr. ​Kjiersten Fagnan
DOE Joint Genome Institute
University of California, Berkeley, CA
https://jgi.doe.gov/about-us/organization/strategic-management/kjiersten-fagnan/

18:00 - Xpress presentation, group 02

First Group of presenters 
Group information will be send to the presenting authors close to the event.

18:00 - Software demonstration

First Group of presenters 
Group information will be send to the presenting authors close to the event

09:00 - ​Diminuindo fronteiras e ampliando colaborações: a Bioinformática no Norte-Nordeste do Brasil.

A mesa contará com a participação de 2 pesquisadores/professores que foram essenciais no pioneirismo e na expansão da área de Bioinformática nas regiões Norte e Nordeste do Brasil. Além deles, contaremos também com a participação de dois jovens pesquisadores que atuam na área, um de cada região, onde eles irão falar dos desafios de iniciar um grupo de pesquisa e estabelecer colaborações. A discussão, conduzida por um host, incluiria também as dificuldades, a formação de mão-de-obra, as novas oportunidades e o desenvolvimento recente do mercado de trabalho e de startups e empresas, sempre relacionando com o provável impacto de uma regional da AB3C para incentivar e catalisar novas ações para à expansão e ampliação da Bioinformática no Norte e Nordeste do Brasil.
Mais informações


10:30 - ​​Contribuições da Bioinformática no combate a COVID-19

Atividade aberta a todos os participantes sob a responsabilidade da regional Sul

12:00 - bioinfo lounge

TBA

14:00 - Mesa redonda: ​Os desafios da formação interdisciplinar em bioinformática e as perspectivas para os egressos 

Gustavo Antônio de Souza, 
Programa de Pós-Graduação em Bioinformática - UFRN. 

Ana Carolina Ramos Guimarães, 
Programa de Pós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemas - Instituto Oswaldo Cruz
 
Mauro A. A. Castro, 
Programa de Pós-Graduação Associado em Bioinformática - UFPR/UTFPR

Vinícius Maracajá-Coutinho 
UChile

Terá a participação de coordenadores de PPGs que desenvolvem pesquisas em Bioinformática com os seus pontos de vista sobre os desafios encontrados e possíveis soluções, seguidos de discussão e perguntas.

16:00 - kEYNOTE: ​Opportunities and challenges of computational data-driven immunology

Prof. Serghei Mangul, Ph.D.
Mangul Lab
University of Southern California (USC) - School of Pharmacy

https://mangul-lab-usc.github.io/

16:45 - liga brasileira de bioinformática

Liga Brasileira de Bioinformática (LBB), um projeto idealizado pela ISCB RSG-Brazil (www.rsg-brazil.iscbsc.org) em parceira com a AB3C (https://www.ab3c.org.br/site/) que teve sua primeira edição em 2019. 

17:05 - assembleia ordinária da ab3c

Evento de grande importância para a nossa sociedade. Nesta assembleia serão deliberados pela maioria pontos importantes para o prosseguimento das atividades da AB3C para o ano de 2021 e 2022.

18:05 - Encerramento e premiações

Pre event

From October 25th to 26th

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